始動用と駆動用の２つのバッテリーがあるのでれば、始動時に駆動用バッテリー（ハイブリッドバッテリー）が空でも問題なさそうに思いますが、警告メッセージなのか、整備士の回答なのかわかりませんが謎ですね。マニュアルに書かれていなければ、駆動用バッテリーに対してユーザーでの外部充電は不可なのでしょう。